Недоброжелатели видели во всех действиях Сергея Жилкина, направленных на искоренение взяточничества, стремление избавиться от неугодных подчиненных. Так или иначе, ТГУ среди местных учебных заведений стал рекордсменом, причем с большим отрывом, по числу преподавателей, осужденных за взятки, мошенничество и злоупотребление должностными полномочиями. А его руководитель стал главным из тех, кого обиженные винили в своих бедах.      

      Немало кривотолков вызвало ноу-хау Сергея Федоровича: введение на официальном сайте Тольяттинского государственного университета так называемой тревожной кнопки - электронного почтового ящика, куда любой желающий мог отправить сообщение по поводу незаконных действий преподавателей. Все сообщения рассматривались лично и только Сергеем Жилкиным, который заявлял, что таким образом он налаживает мост со студентами, которые боятся открыто говорить о мздоимстве. Не обошлось без скандала, который разгорелся после того, как публичное недовольство самим существованием «тревожной кнопки» выразил Николай Живоглядов, бывший доцент кафедры «Техническая эксплуатация и ремонт автомобилей». По утверждению доцента, именно порочащие анонимки неизвестных «доброжелателей» стали причиной гонений на него и последующего увольнения из учебного заведения, которому он отдал 25 лет жизни. Николай Живоглядов написал в гражданский суд несколько исков с просьбой закрыть электронный ящик и компенсировать причиненный ему моральный вред в размере 250 тысяч рублей.                  После нескольких заседаний истец отказался от денежных претензий и заключил с отвечавшей стороной мировое соглашение, по которому Сергей Жилкин обязался в оговоренные сроки взамен существовавшего сайта создать новый образовательный портал ТГУ, где бы не упоминалось слово «взятка».

      Сложно предположить, что этот вузовский междусобойчик стал причиной убийства ректора. Но, как показывает практика расследования подобного рода убийств, исключать ничего нельзя.